Фамилия Пондин ведет свое начало от прозвища Пондя. Возможно, оно образовано от глагола «пондерить», который в вологодских краях употреблялся в значении «достать, добыть, приобрести». Следовательно, такое прозвище могло принадлежать человеку предприимчивому и домовитому. Согласно другой маловероятной гипотезе, подобное прозвище могла произойти от английского pond – «пруд, маленькое озеро». В этом случае оно указывала на место проживания предка ее обладателя, поселившегося близ одного из водоемов Соединенного Королевства. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пондя, со временем получил фамилию Пондин.