Фамилия Понин образована от прозвища Пона. Оно происходит от двойной глагольной приставки «пона», которая имеет значения ограничения, смягчения или усиления действия. Вполне возможно, что Поной прозвали человека за его привычку часто использовать в своей речи глаголы с этой приставкой (например, «понагрубил», «понажить», «понаслушаться» и т.д.). Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пона, со временем получил фамилию Понин.