Фамилия Потупко почти наверняка украинская, и её выдает суффикс -ко. В украинской ономастике этот суффикс — один из самых распространенных способов образования фамилий, он часто заменял русское -ов/-ев или польское -ский. В основе фамилии лежит прозвище или мирское имя Потупка, а оно, в свою очередь, происходит от глагола «потупляти» — опускать вниз, потупить взор. То есть Потупкой могли назвать человека с привычкой ходить, потупив глаза, — скромного, застенчивого или, напротив, хитрого, кто прячет взгляд.

Есть и вторая, менее очевидная версия. В некоторых говорах «потупкать» значило «потоптать», «помять». В этом случае прозвище могло относиться к человеку неаккуратному или, наоборот, к тому, кто топчет траву, работает в поле. Однако первое объяснение — через потупленный взгляд — встречается в ономастических словарях чаще и считается основным.

Географически фамилия Потупко тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Полтавщине и Черкащине. Встречается и в Беларуси, но значительно реже. В России эта фамилия редкая и, скорее всего, попала туда с переселенцами с Украины в XIX–XX веках. Социальный состав носителей — в основном крестьяне и казаки, так как украинские фамилии на -ко массово закреплялись именно в этих сословиях.

Любопытно, что ударение в фамилии плавающее: можно услышать и ПотУпко, и ПотупкО. В украинском языке нормативным считается ударение на последний слог, что характерно для многих фамилий на -ко (Шевченко, Нестеренко). В русском языке под влиянием аканья и иной ритмики ударение часто смещается на второй слог.

Однокоренные фамилии — Потупов, Потупа, Потупчик. Все они восходят к тому же корню, но различаются суффиксами, которые указывают на разную территорию и время возникновения. Потупко — типичный пример украинской фамилии, которая по одной букве в окончании сразу выдает происхождение своего рода.