Фамилия Примизенкин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано не с характером или внешностью, а с конкретным географическим местом. Её ядро — топоним Примизенье или Примизенье. За ним угадывается название речки, оврага или урочища, где «мизень» — диалектное слово, означающее «мелкий, неглубокий» (сравните с «мизерный»). Человек, живший «при мизени», то есть у мелкого ручья или низины, получал прозвище Примизеня, Примизень или Примизенка.

Фамилия образована по продуктивной русской модели: от прозвища на -а/-я с помощью патронимического суффикса -ин, указывающего на принадлежность («чей?» — сын Примизенки). Форма Примизенкин — «маленький Примизенка» или «сын Примизенки». В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще давались по именам и профессиям, -ин часто закреплялся за прозвищами, оканчивающимися на гласный или мягкий согласный.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным говорам России, где слово «мизень» было в ходу. Встречается она редко, что указывает на локальное происхождение — вероятно, в одном-двух уездах. Если бы предок был из южных регионов, скорее бы закрепилась форма Примизенков.

Спорных версий здесь немного. Можно предположить искажение фамилии Примизенский (с суффиксом принадлежности к местности -ск-), но -кин на конце говорит в пользу прозвищного происхождения, а не топонимической фамилии дворянского типа. Второй вариант — основа от «примирять» или «мирный», но это натяжка: фонетически «Примизенкин» далёк от «Примиренкин», и диалектная лексика даёт более прямое объяснение.

Таким образом, Примизенкин — фамилия-указатель: она сообщает, что родоначальник жил у неглубокой речки или в низине, которую местные называли Мизень. Никакой тайны в ней нет, зато есть живая связь с ландшафтом и говором тех мест, откуда пошёл этот род.