Фамилия Прокопейкова — женская форма от Прокопейков, и её разбор стоит начать с необычного суффикса. В русских фамилиях часто встречаются -ов, -ев, -ин, но -ейк(ов) — вариант более редкий. Он указывает на то, что в основе лежало не просто имя Прокоп, а его производная, уменьшительная форма — Прокопейко. Такое окончание (-ейко) характерно для украинской и белорусской традиции: оно образовывало ласкательные или обиходные варианты имён (ср. Андрейко, Дмитрейко). Таким образом, Прокопейко — это «маленький Прокоп» или, скорее, «сын Прокопа» в диалектном звучании.

Корень фамилии восходит к каноническому имени Прокопий (от греческого «прокопэ» — успех, преуспевание). В русском быту имя упростилось до Прокоп, а от него пошли многочисленные фамилии: Прокопов, Прокофьев, Прокопьев. Прокопейков стоит в этом ряду особняком — оно не столько от полного имени, сколько от его народной, «домашней» версии. В документах XVII–XVIII веков можно встретить запись «Прокопейко» как прозвище или неполное имя, которое затем закрепилось за потомками.

Географически фамилия Прокопейкова тяготеет к южнорусским и белорусским областям, а также к регионам, куда в разное время переселялись выходцы из Малороссии. Встречается она нечасто, что делает её хорошим маркером локального происхождения рода: скорее всего, предки жили в небольшой волости или селе, где форма «Прокопейко» была привычной. Сословная принадлежность, скорее всего, крестьянская или мещанская — в дворянской среде такие «уменьшительные» фамилии приживались редко.

Спорных версий у Прокопейкова немного. Можно было бы предположить связь с прозвищем Прокопей (от глагола «прокопать»), но это маловероятно: ударение и суффикс указывают именно на имя, а не на действие. Так что основная и единственная убедительная версия — от имени Прокопий через уменьшительную форму Прокопейко, с последующим присоединением типичного русского суффикса -ов.