Фамилия Прокопьуев — один из тех редких случаев, когда написание напрямую указывает на региональное или диалектное произношение. В основе лежит каноническое имя Прокопий (от греческого «преуспевающий», «меч»), которое в русском языке дало множество производных форм: Прокофий, Прокоп, Прокоша. Но суффикс -уев вместо привычного -ев или -ов выбивается из ряда.

Обычно фамилии на -уев (или -уев) образуются от прозвищ или имён, оканчивающихся на -уй: например, Крикун → Крикунов, но в северных и сибирских говорах, а также в украинском и белорусском языках, звук [у] мог заменять [о] или [а] в безударной позиции. Прокопьуев — это, скорее всего, фонетический вариант фамилии Прокопьев, закрепившийся на письме. То есть предка могли звать Прокопий, а в быту — Прокоп, и в документах записали так, как слышали: «Прокопьев» превратилось в «Прокопьуев» через акающее или укающее произношение.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая: основа могла быть не от Прокопия, а от прозвища Прокопьуй — человека, который «прокопал» или «прокоптил» что-то, но такое прозвище не зафиксировано в известных ономастических словарях. Филологи склоняются к тому, что Прокопьуев — это диалектная запись отчества, а не самостоятельное прозвище.

Географически фамилия встречается в основном в центральных и южных областях России, а также среди старообрядцев, где более архаичные формы имён и фамилий сохранялись дольше. В отличие от массовой Прокопьевой, Прокопьуев — редкая фамилия, что делает её носителей легко отличимыми в документах XIX века. Социально предки, скорее всего, были крестьянами или мещанами, так как дворянские роды с таким окончанием практически не встречаются.

Если сравнивать с однокоренными — Прокофьев, Прокопьев, Прокопович, — то Прокопьуев стоит особняком: он не вписывается в стандартную модель на -ов/-ев, а потому в старых переписях мог легко превратиться в Прокопьева или Прокопова из-за ошибки писаря. Так что нынешнее написание — это не искажение, а застывшая живая речь предков.