Фамилия Прокопышен — редкий пример русской фамилии, образованной не от полной формы имени, а от просторечного варианта. В её основе лежит имя Прокоп или Прокопий (греческое Прокопиос — «преуспевающий», «успешный»). В русских говорах это имя часто сокращали и переиначивали: Прокоп, Прокопа, а в некоторых регионах — Прокопыша. Так могли назвать младшего члена семьи, ребёнка или человека небольшого роста с ласково-уменьшительным оттенком.

Суффикс -шен указывает на принадлежность: Прокопышен буквально означает «сын Прокопыши» или «тот, кто из семьи Прокопышей». Обычно такие фамилии закреплялись за детьми или внуками человека, которого в быту звали Прокопыша. По модели образования это типичная «полуотчество»: сначала возникло прозвище Прокопыша, затем от него — фамилия на -ин, но с характерным чередованием (Прокопыша → Прокопышин). Однако написание через «е» — Прокопышен — встречается реже и может быть следствием местного произношения или ошибки писаря, который записывал фамилию на слух.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России, где были распространены формы с суффиксом -ыша (сравните с фамилиями Голышен, Малышен). В документах XVII–XVIII веков можно встретить крестьян и посадских людей с таким именованием, но массового распространения Прокопышен не получил. Сегодня это очень редкая фамилия, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска: каждый носитель, скорее всего, связан с одной небольшой ветвью рода.

Интересно, что в украинской и белорусской традициях аналогичная фамилия чаще звучала бы как Прокопенко или Прокопович, а русский вариант с суффиксом -шен выдает именно северное или владимирское происхождение. Если ваши предки носили эту фамилию, ищите их в переписных книгах Архангельской, Вологодской или Костромской губерний — там вероятность найти «Прокопышей» выше всего.