Фамилия Пронеков — редкий случай, когда основа ясна, а вот способ её оформления вызывает вопросы. Корень здесь — «Пронек». Это уменьшительная форма от крестильного имени Прокопий (греч. «преуспевающий», «преуспевающий в бою»). В народной речи Прокопий превращался в Прокопа, а оттуда — в Проню и Пронека. Такая цепочка типична для русских фамилий: полное имя сокращали, а потом добавляли суффикс, чтобы получить прозвище или фамилию.

Необычность в суффиксе. Подавляющее большинство русских фамилий на -ов образуются от основ, оканчивающихся на согласный: Иванов, Петров. А здесь основа «Пронек» сама заканчивается на -к. Получается, что фамилия Пронеков — это не «сын Пронека», а скорее «принадлежащий Пронеку» или «из рода Пронековых». Такое удвоение суффикса (корень -ек + фамильный -ов) встречается, но реже. Похожая модель — у фамилий Тимофеев (от Тимофей), но там основа на -ей, а здесь на -ек.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с прозвищем Пронёк. В русских говорах «прон» могло означать «проныра», «ловкач», а «пронёк» — уменьшительное. Тогда фамилия образована напрямую от прозвища, без крестильного имени. Но из-за того, что форма «Проня» и «Пронек» широко известна именно как производные от Прокопия, первая версия основная.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским землям. В документах XVIII–XIX веков Пронековы встречаются в Курской, Воронежской губерниях и на Слобожанщине. Там имя Прокопий было особенно популярно, и его уменьшительные формы дали много фамилий: Прокопов, Прокопьев, Пронин, Пронченко, Пронеков.

По сословной принадлежности — почти наверняка крестьянская или однодворческая фамилия. Дворянских родов Пронековых в родословных книгах не зафиксировано. Предки носителя этой фамилии, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, получившими фамилию по имени деда или отца в эпоху массового закрепления фамилий в XIX веке.