Фамилия Пруняков — редкий случай, когда корень слова не лежит на поверхности. В отличие от десятков фамилий на «-яков» от очевидных имён (Иван — Иваняков), основа «Прун» заставляет задуматься. Самая вероятная версия: в основе лежит прозвище Пруняк. В русских говорах «прун» или «пруня» — диалектное название прута, хворостины, тонкой ветки. Прозвище Пруняк могли дать человеку сухощавому, высокому и гибкому, либо, напротив, тому, кто ходил с прутом или работал с лозой (корзинщик, плетельщик). Суффикс «-як» в таких прозвищах характерен для южнорусских и украинских говоров, он придаёт слову оттенок носителя признака: Пруняк — «прутяной», «прутоподобный».

Другая версия, менее распространённая, связывает фамилию с дохристианским именем Прун. В древнерусских именословах встречались имена от названий растений и предметов, но документальных подтверждений имени Прун в летописях нет. Третья гипотеза — искажённое «Пруня» как форма имени Прокофий или Прусий, но такое стяжение маловероятно: от Прокофия ждали бы Прокофьев или Пронин, а от Прусия — Прусьев.

Фамилия Пруняков — отчество второго порядка: сначала от прозвища Пруняк образовали притяжательное прилагательное «Пруняков сын», а затем оно застыло в фамилии. Модель «-ов» указывает на русскую, а не украинскую или белорусскую среду. Географически фамилия редкая, встречается в центральных областях России и в Поволжье, что косвенно подтверждает диалектный характер прозвища. Сословно это, скорее всего, крестьянская или мещанская фамилия: прозвища от бытовых предметов и явлений редко давали дворянам.

Поиск по однокоренным фамилиям (Прунов, Прутков, Прутяков) показывает, что все они тяготеют к значению «прут», «ветка». Пруняков стоит в этом ряду особняком из-за необычного суффикса «-як», который делает фамилию более живой и диалектной. Если ваши предки носили эту фамилию, можно с уверенностью говорить о русских корнях, уходящих в крестьянский быт, где прозвище по внешности или занятию было нормой.