Фамилия Прыгун — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не требует расшифровки. В прямом значении прыгуном называли человека, который хорошо и далеко прыгает. Но за этой простотой скрывается не одна, а целых три возможных профессиональных и бытовых подоплёки.

Первая версия — самая очевидная: прозвище дали ловкому и подвижному человеку, возможно, плясуну или акробату. В народной среде ценили физическую сноровку, и удачное прозвище легко закреплялось за родом. Вторая нить ведёт к ремеслу. В некоторых говорах «прыгуном» называли не только человека, но и особый вид ткацкого челнока, который «прыгал» в станке. Мастер, работавший с таким челноком, — ткач — тоже мог получить такое прозвище. Третья, менее распространённая версия, связывает фамилию с диалектным словом «прыгун» — так в ряде областей называли кузнечика или сверчка. Прозвище могло достаться невысокому, вертлявому человеку или тому, кто много говорил.

Модель образования фамилии предельно проста: это типичная «прозвищная» фамилия без суффикса, оформившаяся путём перехода имени собственного в наследственное. В русской ономастике такие фамилии встречаются, но реже, чем патронимические на -ов и -ин. Отсутствие суффикса указывает на то, что прозвище Прыгун могло закрепиться в среде, где фамилии ещё не были обязательными, — у крестьян или посадских людей до эпохи всеобщей паспортизации.

Географически фамилия редкая и не образует плотных гнёзд. Единичные носители встречаются в разных регионах России, но заметного скопления, в отличие от однокоренных Прыгуновых или Прыгаловых, не наблюдается. Это говорит о том, что фамилия возникла независимо в разных местах, а не распространилась из одного родового центра.

Сравнение с однокоренными фамилиями показательно. Прыгунов — более массовый вариант, образованный стандартным суффиксом -ов, который «причесал» прозвище под общую модель. Фамилия Прыгун сохранила исходную, более архаичную форму. Так что носители фамилии Прыгун могут считать себя наследниками прозвища, которое не стали «облагороживать» суффиксом, — оно осталось в том виде, в каком его дали предку.