Фамилия Пуко — редкая и неоднозначная по происхождению. Её носители встречаются в основном в Беларуси, на западе России и в Прибалтике, что сразу подсказывает: корни стоит искать не в центральнорусской, а в западнославянской или балтийской среде.

Самый простой и правдоподобный путь — прозвище. В белорусском и украинском языках «пука» или «пуко» может означать нечто вздутое, пухлое, толстое (сравните с диалектным «пукатый» — пузатый). Так могли прозвать полного или медлительного человека, а может, и того, кто любил прихвастнуть, «надуться» важностью. Фамилия образована без типичного русского суффикса -ов/-ев, что характерно для украинских, белорусских и польских фамилий на -о: Путько, Ковалько, и Пуко — как раз из этого ряда. Суффикс -к- в таких фамилиях часто уменьшительно-ласкательный или указывает на принадлежность к роду.

Вторая версия, менее очевидная, но имеющая право на существование, — балтийская основа. В литовском языке «pukas» — пух, пушок, а «pukė» — копна, пучок. Прозвище Пуко могли дать человеку с пушистыми или всклокоченными волосами. В пользу этой гипотезы говорит география фамилии: она фиксируется в Литве и в пограничных с ней районах Беларуси. Сравните с литовскими фамилиями Пукас, Пукис, которые образованы от того же корня.

Третья, совсем редкая возможность, — связь с глаголом «пукать» (стрелять, хлопать, издавать глухой звук). В некоторых русских говорах так называли охотника или сторожа с ружьём, но это скорее экзотика для фамилии без суффикса.

Сословная принадлежность предков Пуко, скорее всего, крестьянская или мещанская. Фамилии на -о без патронимического суффикса — типичный признак незакрепощённых слоёв или жителей западных губерний Российской империи, где фамилии часто фиксировали в XIX веке по прозвищу главы семьи без дополнительных морфологических изменений.

Итак, наиболее вероятно, что фамилия Пуко — западнославянское или балтийское прозвище, данное по внешнему признаку (полнота, пухлость, пушистость). Её носители — потомки людей, которых в деревне звали Пуком за характерную стать или причёску.