Фамилия Ратковский — классический пример фамилии, образованной по польско-шляхетской модели от географического названия. Суффикс -ский (в польском варианте -ski) указывал на принадлежность к месту: владельца поместья или выходца из него. Носитель фамилии Ратковский, скорее всего, происходил из населённого пункта вроде Ратков, Ратково или Раткув. Такие топонимы встречаются на территории современной Польши, Беларуси и Украины, что неудивительно: фамилия имеет выраженное западнорусское (белорусское) и польское происхождение.

Основа «Ратк-» восходит к личному имени Ратко — краткой форме от славянских имён с корнем «рат-» (например, Ратибор, Ратмир, Ратислав). «Рат» в древнерусском и старославянском означало «война», «битва», «воинская сила». Таким образом, имя Ратко могло быть уменьшительным для человека, связанного с военным делом, или же давалось как оберег-пожелание воинской доблести. Прозвище Ратко известно по древнерусским летописям: так звали, в частности, одного из бояр князя Даниила Галицкого в XIII веке.

В Российской империи фамилия Ратковский была распространена среди дворянства и шляхты западных губерний — Виленской, Гродненской, Волынской, Киевской. В ревизских сказках и метрических книгах XIX века носители фамилии встречаются как мелкопоместные дворяне, реже — среди мещан и однодворцев. Переселенцы с этими корнями позже осели в Сибири и на Дальнем Востоке, куда их зачастую ссылали после польских восстаний 1830–1831 и 1863–1864 годов.

В отличие от более частых фамилий на -ов/-ев, Ратковский сохранил польский суффикс, что делает его маркером определённой социальной среды: шляхты, которая дорожила родовым прозванием и не дала ему обрусе́ть. Если искать однокоренные фамилии, то Ратников, Ратнов и Ратманов — это уже чисто русские варианты, образованные от той же основы, но по другой модели.