Фамилия Репенин — одна из тех, что образована от прозвища или мирского имени, которое могло звучать как Репеня. Основа здесь — «репа», корнеплод, который в русской деревне до картофеля был вторым хлебом. Суффикс -ин указывает на принадлежность: буквально «чей?» — сын Репени, человек из рода Репениных.

Разберёмся с прозвищем. Репеней могли назвать человека за внешнее сходство: круглолицего, коренастого, с румяными щеками — этакий «репой» в смысле формы и цвета. Менее очевидный, но возможный вариант: прозвище давали по характеру — упёртому, «крепкому, как репа», или, наоборот, простоватому, «репному» уму. В ономастике известен случай, когда прозвище Репа фиксировалось в новгородских писцовых книгах XV века, а фамилии на -ин от него — типичный севернорусский тип.

Фамилия редкая, и её география подсказывает кое-что интересное. Основной ареал — не центральная Россия, а Поволжье и Урал. В частности, носители Репениных встречаются в Пермском крае, Кировской области, а также среди староверов. Это намекает на то, что фамилия могла закрепиться в среде государственных крестьян, которые селились на казённых землях за Волгой в XVII–XVIII веках. Сословно — почти наверняка крестьянство, без дворянских корней: фамилии на -ин, образованные от названий овощей, в дворянской среде практически не встречались.

Интересная деталь: фамилия могла писаться и как Репени́н с ударением на последний слог, что для -ин-фамилий нетипично (обычно ударение на основу). Это могло возникнуть под влиянием местных говоров, где прозвище произносили «репеня́» с ударением на «я». В документах XIX века встречаются варианты «Репенев» — с суффиксом -ев, что говорит о неустойчивости окончания в устной речи, но форма «Репенин» закрепилась как литературная.

Если искать однокоренные фамилии — Репин, Репкин, Репьёв — они все от той же «репы», но каждая со своим оттенком. Репенин стоит особняком: суффикс -ин здесь не от «репа», а от уменьшительно-ласкательного «репеня», что делает фамилию более «домашней», личной, а не просто описательной.