Фамилия Рукинова — женская форма фамилии Рукинов. Чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с мужским вариантом, а он, на первый взгляд, прозрачен: основа «рука». Но здесь есть тонкость.

Самый вероятный путь образования — от прозвища Рука. В старину так могли назвать человека с какими-то приметными руками: большими, сильными, ловкими или, наоборот, с повреждённой рукой. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Рукинов, то есть сын или потомок человека по прозвищу Рука. Модель типичная для русских фамилий XVI–XVII веков, особенно в среде крестьян и посадских людей.

Менее распространённая, но правдоподобная версия — происхождение от неканонического имени Рука. В древнерусской антропонимии имена по частям тела встречались (Нога, Губа, Лоб) и выполняли роль оберегов: считалось, что злые духи не позарятся на ребёнка с «некрасивым» именем. В этом случае Рукинов — потомок человека, носившего такое имя-оберег.

Фамилия редкая. Географически может встречаться на Русском Севере и в центральных областях России, где сильна традиция прозвищных фамилий на -ин. В некоторых говорах «рука» могла означать не только конечность, но и поручительство, ручательство — тогда прозвище мог получить надёжный человек или поручитель при сделке.

С точки зрения словообразования важно, что фамилия не содержит уменьшительных суффиксов. Перед нами прямая основа, что указывает на древность прозвища: его дали взрослому человеку по яркому признаку, а не ребёнку. Никаких дворянских корней у Рукиновых обычно не прослеживается — это фамилия крестьянского или мещанского сословия, фиксировавшаяся в переписных книгах с конца XVII века.