Фамилия Садунин образована от прозвища Садуня. Основа — «сад», но не в значении «фруктовый сад», а от глагола «садить» в одном из его переносных смыслов. В русских говорах «садуном» называли того, кто постоянно присаживается, не может усидеть на месте, или, наоборот, человека медлительного, который «садится» надолго. Второй вариант: прозвище могли дать плотнику или строителю — тому, кто «садит» (вставляет, вгоняет) детали, например, бревна в сруб.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Садунин — «сын Садуни». Это типичная модель русских фамилий XVI–XVII веков, когда отчество в родительном падеже закреплялось за потомками. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще образовывались от имен или прозвищ на твердый согласный, суффикс -ин характерен для основ на -а, -я. Садуня — как раз такой случай: уменьшительно-пренебрежительная форма с окончанием -я.

Географически фамилия редкая. Встречается в основном в центральных и южных областях России, а также в Поволжье. В дореволюционных переписях Садунины фиксировались среди крестьян и мещан. Дворянских родов с такой фамилией нет — это однозначно фамилия простонародная, что подтверждается и прозвищной, а не календарно-церковной основой.

Спор о корне «сад» иногда заводят в сторону тюркских языков, где «сад» означает «счастливый» или «верный». Но для русской фамилии это натяжка: слово «сад» в тюркизмах (например, Садык) давало бы форму Садыков или Садыкин, а не Садунин. Правдоподобнее держаться славянской глагольной версии.

Если сравнить с однокоренными фамилиями — Садов, Садовников, Садилов, — то Садунин стоит особняком. У него нет связи с профессией садовника или топонимом «сад». Это прозвище по характеру или бытовой привычке, что делает фамилию более личной и конкретной, чем ремесленные фамилии того же корня.