Фамилия Саматоев — один из тех случаев, где за привычным русским суффиксом -ев скрывается нерусская, скорее всего тюркская, основа. Вопреки возможному впечатлению, фамилия не связана с «сам» или «само» (как Самойлов или Самсонов). Её ядро — имя или прозвище Саматой, которое в русской среде адаптировали по стандартной модели: прибавили суффикс принадлежности -ев, получив буквально «сын Саматоя».

Корень «Самат» широко распространён у тюркских народов. Он восходит к арабскому имени Самат (ас-Самад) — «вечный», «независимый», один из эпитетов Аллаха. Форма Саматой могла возникнуть как ласкательный или уменьшительный вариант: в тюркских языках суффикс -тай/-той (например, Ахметтай, Исматой) часто придаёт имени оттенок близости или младшего возраста. Таким образом, Саматой — это «маленький Самат», «Самат-сынок».

По географии фамилия Саматоев редкая. Её очаги стоит искать в Поволжье (Татарстан, Башкортостан) или среди казахских и башкирских родов, где имя Самат традиционно популярно. В русских переписных книгах XVII–XVIII веков такие фамилии фиксировали у служилых татар, перешедших в православие, или у крещёных инородцев, чьи потомки обрусели. Суффикс -ев (а не -ов) тоже показателен: он ставится после мягких согласных и й, что подтверждает исходное окончание основы на -ой.

Встречается иная, менее вероятная версия: от прозвища Саматый — «самый тот», «такой же», но она не подкреплена диалектными данными и ломает словообразовательную логику — прозвища на -ой редко становились основой фамилий без дополнительного переоформления. Гораздо правдоподобнее, что предок носителя фамилии Саматоев был назван по имени Саматой — и это имя, пройдя через века, осталось в суффиксе, который сейчас кажется чисто русским.