Фамилия Самородина происходит от личного прозвища Самород, которое в XV веке фиксируют письменные источники. В «Ономастиконе» Степана Веселовского упомянут Самород Иван, крестьянин из Дмитрова, 1475 года. Это одно из самых ранних свидетельств бытования прозвища, и именно от него, а не от имени или ремесла, образована фамилия.

Основа прозвища — прилагательное «самородный», то есть «природный, естественный, сам собой возникший». В старом языке слово имело и более конкретный хозяйственный смысл: «самородная соль» означала соль самосадочную, которую не вываривали, а добывали готовой. Но применительно к человеку прозвище Самород, скорее всего, подчеркивало характер. Так могли назвать самостоятельного, ни от кого не зависящего человека или того, кто выделялся природным даром, самородным талантом. Версия о «природном» значении выглядит правдоподобнее: прозвища от черт характера в ту эпоху встречались чаще, чем бытовые сравнения с солью.

Словообразовательная модель проста: к основе Самород добавили типичный для русских фамилий суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Фамилия Самородина буквально значит «дочь, жена или потомок Саморода». Форма на -ин, а не на -ов, характерна для фамилий, образованных от слов, оканчивающихся на твердый согласный, и здесь она органично слилась с прозвищем.

Прозвище Самород не было редкостью в северных и центральных русских землях, о чем свидетельствует дмитровская запись. Со временем оно закрепилось как основное именование человека, а затем перешло в фамилию, которую унаследовали потомки. Так за человеком, которого в XV веке знали как Саморода, закрепилась память о его самостоятельности или одаренности, и эта память дожила до наших дней в фамилии Самородина.