Фамилия Самынин — это классический пример русской «полуотчественной» фамилии, образованной не от полного церковного имени, а от его домашней, уменьшительной формы. Основой послужило имя Самыня — так в быту могли называть человека с библейским именем Самуил. Само имя Самуил пришло на Русь вместе с христианством из древнееврейского языка и означает «услышанный Господом»: по библейскому преданию, пророк Самуил был вымолен у Бога его матерью.

Словообразовательная модель здесь простая и очень распространённая: к основе на -я добавляется притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность. То есть Самынин буквально значит «сын Самыни». Такая модель в XV–XVII веках активно вытесняла более архаичные формы с суффиксом -ов/-ев и закрепилась в северорусских и центральных говорах. Интересно, что фамилия сохранила именно эту, более «домашнюю» форму, тогда как от полного имени Самуил образовались другие фамилии — Самуилов и, реже, Самойлов (через народную форму Самойло).

О точном месте возникновения фамилии говорить сложно: процесс закрепления прозвищ и отчеств в качестве наследственных родовых имён шёл несколько столетий и завершился в разных регионах в разное время. Однако сам факт, что в основе лежит уменьшительное имя, а не полное, говорит о том, что предок Самыниных был человеком уважаемым в своей округе, но при этом своим, «домашним» — настолько, что его звали не по святцам, а по-свойски.

Сама по себе фамилия Самынин — редкая, её не встретишь в списках титулованного дворянства или купеческих гильдий. Скорее всего, её носили крестьяне, посадские люди или однодворцы. В этом её ценность: она сохранила живую народную традицию имянаречения, когда церковное имя перекраивалось на русский лад, а потомок получал память о предке в виде короткого и ёмкого родового прозвища. Разбор фамилии показывает, что перед нами не случайный набор звуков, а застывшая история конкретной семьи, уходящая корнями в эпоху формирования русских родовых имён.