Фамилия Санины образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой послужило церковное имя Александр: Саня — просторечная форма этого крестильного имени, которое в переводе с греческого означает «мужественный; защитник людей». Фамилия отвечает на вопрос «чей?» и указывает на прямого потомка человека по имени Саня: Санин — сын Сани.

В словаре С. Б. Веселовского упоминаются Санин Федор, 1450 г., Кострома; Санин Авдий, крестьянин, 1606 г., Белев. Эти ранние записи показывают, что фамилия бытовала в разных социальных слоях и уже в XV–XVII веках встречалась в центральной России. О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно, поскольку процесс формирования русских фамилий был длительным и шёл неравномерно в разных землях.

Интересно, что фамилия Санины закрепилась именно за краткой формой имени, а не за полным Александров. Это типичная модель: в повседневном общении на Руси чаще использовали уменьшительные имена, поэтому они и становились основой для фамилий. Родственные по модели фамилии — Сашков, Сашутин, Шурин, но Санины выделяются тем, что их основа звучит как самостоятельное имя, а не как производное от него.

Фамилия Санин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры: она сохранила живую народную форму имени, которая почти не встречается в официальных документах, но была широко распространена в разговорной речи.