Фамилия Санко — хороший пример того, как одна буква меняет историю. Если не вглядываться, её легко принять за украинскую или белорусскую фамилию на -ко (вроде Шевченко, Бондаренко). Но на деле Санко — это русская фамилия, и ключ к ней лежит не в суффиксе, а в основе.

Основа здесь — краткая форма крестильного имени Александр. В народной русской традиции это имя давало множество производных: Саня, Саша, Шура, а также Санко. Форма Санко — это уменьшительно-ласкательный вариант, который бытовал в северных и центральных говорах. Суффикс -к- здесь не фамильный (как у украинских фамилий), а уменьшительный, и фамилия образовалась по простой модели: от прозвища Санко (так могли звать человека в быту) путём его застывания. То есть перед нами не «Санко» как самостоятельная фамилия с суффиксом, а фамилия, совпавшая с именем-прозвищем. Это так называемые «патронимы в чистом виде» — когда отчество или прозвище не получило дополнительного суффикса -ов/-ев.

Вторая, менее вероятная версия отсылает к географическому названию. В Польше и Беларуси есть топонимы Санки (деревни), а также река Сан. В этом случае фамилия могла указывать на выходца с тех мест. Но для русской фамилии Санко это скорее исключение: слишком уж естественно объяснение через имя Александр.

Интересно, что фамилия Санко встречается не только у русских. У украинцев она тоже есть, но там она строится по другой модели — как типичная фамилия на -ко от прозвища Санько (украинская форма того же Александра). Русская же версия тяготеет к северу: в архангельских, вологодских, вятских переписях XVII–XVIII веков можно найти крестьян и посадских людей с такой записью. Никаких дворянских родов с этой фамилией не зафиксировано — предки носителя фамилии Санко, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками.

Так что если вы Санко, ваш предок, вероятно, звался Александром, но в быту его называли ласково — Санко. И это имя закрепилось за родом без всяких дополнительных суффиксов, в самой простой и древней форме.