Фамилия Санюк в подавляющем большинстве случаев — это краткая, домашняя форма канонического имени Александр. В переводе с греческого оно означает «мужественный; защитник людей», и от него в русском и соседних славянских языках образовалось множество уменьшительных вариантов: Шура, Саня, Санька и, в том числе, Санюк. Именно эта производная форма и закрепилась в качестве фамилии. Такой путь — от крестильного имени через обиходное прозвище к фамилии — был самым распространенным на Руси, поэтому версия об Александре выглядит основной.

Менее вероятно, но всё же возможно, что фамилия связана с нарицательным «сани». Так называли повозку без колес на полозьях, которую запрягали лошадьми, оленями, быками или собаками. В этом случае прозвище Санюк мог получить либо мастер, делавший сани, либо извозчик. У этой версии есть своя логика, подкрепленная историей: в допетровской Руси дороги и улицы оставляли желать лучшего, а сани были сравнительно дешевы, поэтому они оставались самым ходовым транспортом даже летом. В болотистых и лесистых местах Архангельской, Вологодской, Олонецкой и Костромской губерний на санях ездили вплоть до начала XX века. Более того, езда на санях считалась почетнее, чем на колесах: их использовали в торжественных случаях, а высшие духовные лица предпочитали их даже в летний зной до конца XVII века. Старинные сани напоминали лодку с загнутыми спереди и сзади краями или длинный ящик, суживающийся к передку, в котором можно было лежать.

География фамилии тоже говорит в пользу славянского, скорее западного, происхождения. В Ленинградском мартирологе упоминается поляк Санюк Александр Матвеевич, родившийся в 1870 году в Виленской губернии, Свенцянском уезде, в деревне Кривоносы. А в архивах белорусского общества «Мемориал» записан Санюк Анатолий Павлович, рожденный в 1887 году в деревне Лозяны Желудокского района Гродненской области. Оба примера указывают на территорию бывшего Великого княжества Литовского, где суффикс -юк был особенно продуктивен при образовании фамилий, и это еще один аргумент в пользу того, что перед нами не случайное совпадение, а устойчивая региональная модель именования.