Вероятно, прозвища Саян образовалось от аналогичного нарицательного в значении «распашной сарафан, верхняя или нижняя юбка, женский плащ». Саян мог быть портным или продавцом женской одежды. Есть мнение, что это прозвище восходит к слову «саян» в значении «монастырские крестьяне». Саянами также шутливо называли жителей Курска. В этом случае подобное прозвище могло указывать как на социальное положение, так и на место жительства основателя рода. Не исключено, что фамилия Саян образована от мужского тюркского имени Саян. Оно связано с топонимом Саяны - так называются горы на юге Сибири. Возможно, что их название — это искажённое монгольское слово «саган» — «белый». По другой версии, название гор восходит к этнониму сойон (или сойоты, теперь — тувинцы).