Фамилия Сейтханов — яркий пример фамилий, образованных от составных арабских или тюркских имен, где вторая часть — «хан». В данном случае основа «Сейт» представляет собой фонетический вариант имени Сеит, которое восходит к арабскому Сайид (господин, потомок пророка Мухаммеда). В тюркской среде, особенно у крымских татар, ногайцев и народов Кавказа, имя Сеит и его варианты были широко распространены, а добавление «хан» (властитель, правитель) усиливало значение, делая имя пожелательным: «благородный правитель» или «господин-хан».

Суффикс «-ов» в фамилии Сейтханов указывает на русскую модель образования фамилий, которая закрепилась в документах при переписях и введении паспортной системы в XIX–XX веках. По сути, это типичная «притяжательная» форма, отвечающая на вопрос «чей?»: сын Сейтхана. То есть фамилия пошла от отца по имени Сейтхан, который, в свою очередь, получил составное имя.

Географически фамилия Сейтханов наиболее характерна для народов Северного Кавказа (чеченцы, ингуши, кумыки), а также для крымскотатарской и ногайской диаспор. Среди чеченцев, например, имя Сейтхан (Сайтхан) встречается как тейповое (родовое) имя, и фамилия могла закрепиться за целым родом. Встречается она и у казахов, но реже — там более типична форма Сейтхан без суффикса «-ов» или с окончанием «-ұлы».

Интересная деталь: в некоторых тюркских языках, особенно в кумыкском и ногайском, имя «Сейт» могло сливаться с «хан» не просто как два слова, а как единый титул — «сейит-хан», то есть хан из рода сейидов. Таким образом, предок носителя фамилии мог быть не просто человеком с именем, а представителем духовной аристократии, сочетавшей светскую власть (хан) и религиозный авторитет (сейид). Однако для большинства рядовых носителей фамилия просто указывает на то, что их предка звали Сейтхан, без претензий на знатное происхождение.