Фамилия Шафар — редкий случай, когда корень слова почти не изменился при переходе в фамилию. В большинстве славянских фамилий основа обрастала суффиксами (-ов, -ин, -ский), но Шафар сохранила исходную форму. Это указывает на позднее оформление или на то, что фамилия пришла из языков, где подобные модели обычны — например, из польского, чешского, украинского или идиша.

Скорее всего, в основе лежит слово «шафар» — вариант названия профессии. В польском и чешском языках szafarz или šafář означает «эконом», «ключник», «управляющий хозяйством» или «казначей». В старину так называли человека, который ведал припасами, распределял продукты и следил за амбарами. В восточнославянских землях это слово тоже встречалось, но реже — чаще говорили «шафарь» или «шафарка». Таким образом, предок носителя фамилии Шафар мог быть доверенным лицом в поместье, монастыре или при дворе, отвечавшим за материальные ценности.

Есть и вторая, менее распространенная версия: связь с еврейской фамилией Шафар (שפר), которая восходит к слову «шофар» — ритуальный бараний рог. Но в таком случае фамилия обычно писалась через «о» (Шофар) или с удвоением. Для славянского варианта «Шафар» профессия эконома выглядит убедительнее.

Географически фамилия чаще всего встречается в западных регионах Украины, в Польше и среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке. В России она остается малочисленной — носителей можно встретить в Краснодарском крае, Ростовской области и в Москве. Суффикса нет, поэтому фамилия не указывает на принадлежность к конкретному роду или отцу — она прямо говорит о занятии предка.