Фамилия Шанькова образована от прозвища Шанёк. Скорее всего, оно восходит к украинскому слову «шана» - «почет», «уважение», а также «угощение». Таким образом, Шаньком могли называть опытного, уважаемого человека, либо гостеприимного хозяина. Согласно другой версии, в основе этого прозвища лежит глагол «шануть» - «шатнуть, толкнуть; грохнуть, бросить, шарахнуть». В этом случае прозвище Шанёк мог получить неловкий человек. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шанёк, со временем получил фамилию Шанькова.