Фамилия Сидарко — редкий пример восточнославянской фамилии, образованной не от полного, а от сокращённой формы крестильного имени Исидор. В основе лежит народный вариант Сидар, который возник на украинской или белорусской почве: в этих говорах начальное «и» нередко переходило в «ы» или твёрдое «и», а «д» смягчалось. Получается, что Сидар — это то же, что и Сидор, но с местным фонетическим оттенком.

Суффикс -ко в фамилии Сидарко — классический уменьшительно-ласкательный формант для украинских и южнорусских фамилий. В XVI–XVII веках он приставлялся к основе имени или прозвища и означал «маленький», «младший» или просто «сын такого-то». Так Сидарко — это буквально «маленький Сидар» или «сын Сидара». Со временем прозвище закрепилось как наследственная фамилия, и его перестали связывать с возрастом.

Географически фамилия тяготеет к западным и центральным областям Украины, а также к югу Беларуси. В России она встречается редко, чаще — в районах, граничащих с Украиной, например в Брянской, Курской или Ростовской областях. Встречаются и варианты написания: Сидорко, Сидорков, но Сидарко — именно украинский вариант с твёрдым «а» в корне.

Есть и вторая, менее вероятная версия: от прозвища Сида — так в некоторых говорах называли упрямого или медлительного человека. Но эта гипотеза слабее, потому что прозвище Сида не зафиксировано в старых документах как распространённое, а вот имя Сидор (через Исидор) — одно из самых частых в православных святцах. Так что церковное происхождение фамилии — основное.