Фамилия Симендейкина — яркий пример того, как редкое имя или прозвище, выйдя из обихода, остаётся жить в фамилии. В основе лежит мужская форма — Симендейкин. Словообразовательная модель здесь нестандартна: к основе добавляется суффикс -ейк-, который в русских фамилиях встречается гораздо реже, чем привычные -ов, -ев или -ин. Этот суффикс часто придаёт прозвищу оттенок уменьшительности, ласкательности или, наоборот, иронии. В данном случае он наращивается на имя или прозвище Симендей.

Самое правдоподобное объяснение основы — диалектная или просторечная форма имени Симендей, которое восходит к каноническому имени Симеон (в бытовом произношении — Семён). В русских говорах имя Семён могло звучать как Симён, Симон, а в некоторых регионах — как Симендей. Чередование «м» и «н» в корне (Симон — Симен) — явление нередкое для народной этимологии, когда незнакомое слово подстраивают под более привычное звучание. Таким образом, Симендейкин — это «маленький Симендей» или «сын Симендея», то есть потомок человека по имени Семён, которого в быту называли необычной, возможно, шутливой формой.

Вторая версия, менее вероятная, но допустимая: прозвище Симендей могло быть образовано от глагола «симендеть» — редкого местного слова, означавшего «медлить, копаться» или «говорить невнятно». В таком случае фамилия фиксирует характер или манеру поведения предка. Однако в словарях русских говоров этот глагол не зафиксирован широко, поэтому версия с именем остаётся основной.

Фамилия явно недворянская, поздняя по времени формирования — скорее всего, из крестьянской или мещанской среды. Географически она тяготеет к центральным и северным регионам России, где были распространены фамилии на -ейкин (ср. Золотейкин, Бобрейкин). Встречается редко; в современных базах данных носители фиксируются в основном в Нижегородской, Кировской областях и в Пермском крае. Написание с «е» во втором слоге (Симендейкин, а не Симиндейкин) закрепляет старую произносительную норму, где после мягкого согласного слышалось «е», а не «и».