Фамилия Сионихин звучит нестандартно для русского уха, и причина — в редкости её основы. Это классическая «патронимическая» фамилия, отвечающая на вопрос «чей?»: Сиониха → Сионихин. Суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть предок был сыном или человеком из семьи некоего Сионихи. Но кто такой Сиониха?

Здесь мы встречаемся с диалектной или просторечной формой имени. Скорее всего, в основе лежит имя Сион — редкое, но встречавшееся в святцах как каноническое мужское имя (от горы Сион, символа Иерусалима). В народной среде это имя могло получить уничижительный или ласкательный оттенок с суффиксом -иха: Сиониха — так называли жену или вдову человека по имени Сион (по модели «Иван — Иваниха», «Пётр — Петриха»). Соответственно, Сионихин — это сын или потомок Сионихи, то есть женщины из семьи Сиона.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная в южнорусских говорах: прозвище Сиониха могли дать мужчине, который чем-то напоминал «сиону» — так в некоторых областях называли сироту, бобыля или человека, живущего подаянием (от «сирый»). Однако связь с именем Сион выглядит убедительнее, поскольку церковные имена в XVII–XVIII веках активно перерабатывались в бытовые прозвища.

Географически фамилия редкая, встречается в центральных и северных областях России — там, где были крепки традиции отчеств на -их/-ых и суффикса -иха. Носители фамилии, скорее всего, происходили из крестьянской или мещанской среды, где фамилии часто образовывали не от полного имени отца, а от прозвища матери или хозяйки дома. По сути, Сионихин — это «внук Сионихи», и такая модель подчёркивает, что в роду ценили не только отцовскую, но и материнскую линию.

С точки зрения словообразования фамилия интересна тем, что сохранила архаичный женский суффикс -их- в основе, который в современном русском языке почти не используется для образования фамилий, но был распространён в допетровской Руси.