Фамилия Сирен — редкий случай, когда за основу взято не имя, не ремесло и не черта характера, а географический объект, причём не русский, а финский. Всё дело в суффиксе: окончание -ен в фамилиях на северо-западе России — типичный признак карельского или финского влияния. В исконно русских фамилиях такое окончание почти не встречается, зато в Приладожье, на Карельском перешейке и в бывшей Ингерманландии оно обычное дело.

Самая прямая версия: фамилия образована от названия реки Сирены (или Сиренйоки) в Финляндии. Гидроним переводится как «река с ситом» — то есть с быстрым течением, каменистым дном, где вода как бы процеживается сквозь пороги. Человек, живший на такой реке или переселившийся оттуда, получал прозвище по месту, а потом и фамилию. В пользу этой версии говорит и то, что в финской ономастике фамилии на -ен часто указывают на топоним.

Менее вероятная, но возможная версия — от прозвища Сирена. В славянских говорах сиреной могли назвать человека с сиплым, «сиреным» голосом (от слова «сирый» — осипший). Однако в этом случае фамилия скорее приняла бы форму Сиренов или Сиренин, а не Сирен. Сохранение исходного окончания без русского суффикса — дополнительный аргумент в пользу финского корня.

Географически фамилия тяготеет к Ленинградской области и Карелии. Встречается она редко, и в дореволюционных метрических книгах носители чаще всего записаны как крестьяне или мещане из приходов, расположенных вдоль бывшей границы с Великим княжеством Финляндским. Никакой связи с мифическими сиренами или морскими соблазнительницами фамилия не имеет — это чистая звуковая случайность.