Фамилия София — случай редкий и с первого взгляда прозрачный: кажется, что она произошла от женского имени София (греч. «мудрость»). Но здесь есть подвох. В русской традиции фамилии от женских имён образовывали редко и почти всегда через суффикс -ин (Софьин, Софин). София — это не «чьим сыном был предок», а скорее всего, застывшая форма самого имени. Такое возможно, если фамилию давали не крестьянину, а, например, семинаристу: в духовных училищах будущим священникам нередко присваивали звучные фамилии, образованные от имён святых или церковных праздников. София здесь могла отсылать к Святой Софии — матери Веры, Надежды и Любови, либо к храму Святой Софии.

Второй вариант, менее очевидный, — географический. Фамилия могла закрепиться за выходцем из населённого пункта с названием София: такие сёла есть и в России (например, в Башкортостане), и на Украине, и в Болгарии. В этом случае человек получал прозвище по месту жительства — «София», которое со временем стало фамилией без дополнительных суффиксов.

Суффикса в фамилии нет, что для русского уха непривычно: большинство фамилий оканчиваются на -ов, -ев или -ин. София — так называемая «окаменелая» форма, характерная для поздних искусственных фамилий (особенно в среде духовенства) или для фамилий украинского и белорусского происхождения, где подобные бессуффиксные модели встречаются чаще. В словаре Б. Унбегауна такие фамилии от женских имён без суффикса упоминаются как редкие, и София стоит в одном ряду с Вера, Надежда, Любовь — все они могли возникнуть в семинарской среде.

Носители фамилии София сегодня встречаются в России, на Украине и в Беларуси, но численно их мало. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия почти не фиксируется — что косвенно подтверждает её позднее, книжное происхождение. Если ваш предок носил фамилию София, скорее всего, он имел отношение к церкви или жил в местности, где было село с таким названием.