Фамилия Станченкова — женская форма от Станченков, и чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с основой «Станч-» и редким суффиксальным элементом, который сразу отличает её от более распространённых вариантов.

В основе фамилии лежит каноническое имя Станислав или его производная форма. В русской народной традиции полные имена часто сокращали до коротких обиходных вариантов: Станислав превращался в Станя, Стан, Станко, а от них уже образовывали фамилии. Форма «Станч-» — это результат диалектного или просторечного смягчения: «Станко» через уменьшительный суффикс -к- могло дать «Станчко», где «ч» возникло как чередование к/ч. Таким образом, Станченков буквально означает «потомок Станчка» (то есть маленького Станислава).

Ключевая особенность — суффикс -енков. В русской ономастике он характерен прежде всего для южнорусских и украинских территорий, тогда как в северных и центральных регионах чаще использовали -ов/-ев. Фамилии на -енков (Петренков, Иваненков) указывают на то, что предки носителя жили в зоне смешения великорусских и малорусских говоров — на территории бывших Курской, Воронежской, Орловской губерний. Следовательно, Станченков — фамилия с южнорусским «акцентом», и её носители, скорее всего, происходят из крестьян или однодворцев этих земель.

Встречается и другой, менее вероятный вариант трактовки корня. В некоторых говорах слово «стан» могло означать «стойбище», «лагерь», а «станок» — ткацкий станок или место для остановки. Тогда Станченков мог образоваться от прозвища Станок (или Станчо) — человека, связанного с таким местом или ремеслом. Однако связь с именем Станислав остаётся более надёжной, так как фамилии от имён составляют подавляющее большинство в этой модели.

В написании фамилии нет путаницы: Станченкова (с буквой «н» перед «ч») — это нормативное окончание женского рода. Редкость фамилии объясняется тем, что имя Станислав в крестьянской среде до XIX века встречалось нечасто, а южнорусская модель на -енков не стала столь массовой, как -ов.