Фамилия Стацунова — женская форма от Стацунов, и её разумнее всего разбирать именно с мужского варианта. Основа здесь — «Стацун», а суффикс «-ов» указывает на типичную русскую модель принадлежности: «чей?» — Стацунов, то есть потомок или человек из рода Стацуна.

Самая вероятная версия происхождения — от прозвища или неканонического имени Стацун. В русских говорах и в украинском языке слово «стацун» могло означать «постоялец», «квартирант» или «человек, который стоит на постое». Это прозвище давали либо пришлому человеку, который останавливался в чужом доме, либо тому, кто держал постоялый двор. В этом случае предок носителя фамилии был либо сам хозяином, предоставлявшим ночлег, либо человеком, который долго жил не на своём месте.

Менее распространённая, но возможная версия связывает корень с польским или западнорусским словом «стац» (stacja) — станция, почтовая остановка. Тогда Стацун — это человек, приписанный к почтовой станции, ямщик или смотритель. Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским областям, а также к землям бывшего Великого княжества Литовского, где такая лексика была в ходу.

Суффикс «-ун» в основе — характерный для прозвищ, образованных от глаголов (ср. «бегун», «крикун»). В данном случае он мог указывать на деятеля: «тот, кто стацует» — то есть стоит, квартирует. Таким образом, Стацун — это не имя, а социальная характеристика предка, связанная с его образом жизни или занятием. Фамилия редкая, не из числа дворянских, а скорее крестьянская или мещанская, что подтверждается её словообразовательной моделью без приставок и сложных основ.