Фамилия Стефахина — женская форма фамилии Стефахин. В основе лежит имя Стефан (церковная форма) или Степан (народная русская форма), что в переводе с греческого означает «венок», «венец». Однако фамилия образована не напрямую от полного имени, а от его производной, уменьшительной или обиходной формы — Стефаха. Такой способ словообразования (основа + суффикс -ин) типичен для русских фамилий: он указывает на принадлежность к главе семьи, буквально «сын Стефахи» или «вдова Стефахи».

Сама форма Стефаха — редкое для центральной России личное именование, но характерное для южных и западных регионов, где был распространён украинский и белорусский вариант имени Стефан. Суффикс -ах- в таких именах (ср. Макаха от Макар, Гришаха от Григорий) придавал прозвищу оттенок ласкательности или, наоборот, фамильярности, а иногда и просто указывал на человека по имени без дополнительных смыслов. Таким образом, Стефахины могли происходить из семей, где предка звали именно Стефан, и в быту его называли Стефаха.

Фамилия не относится к числу дворянских или широко распространённых аристократических — скорее, это крестьянская или мещанская фамилия, зафиксированная в основном в южнорусских губерниях (Курская, Воронежская, Харьковская) и на Украине. Встречаемость её невысока, что делает каждую ветвь Стефахиных довольно локальной. Если сравнивать с более массовыми Степановыми, то Стефахина — вариант, сохранивший церковное звучание основы, но в простонародной обработке.

С точки зрения словообразования, любопытно, что суффикс -ин в фамилии Стефахина работает не с типичным окончанием на -ов (как у Степанов), а с основой на -ах, что сближает её с фамилиями типа Гришахин, Макашин, Кузьмихин. Это указывает на более древний пласт прозвищных образований, которые не прошли через стандартную унификацию фамилий в XVIII–XIX веках.