Фамилия Стефанчикова восходит к мужскому крестильному имени Стефан, которое в переводе с древнегреческого означает «венок». В церковной традиции это имя связано с первомучеником архидиаконом Стефаном, поэтому в старину оно было широко распространено среди всех сословий, а не только знати. Утверждение о том, что основатель рода непременно был выходцем из высшего сословия, — скорее преувеличение: Стефанами крестили и крестьянских детей, и купеческих, и боярских.

Интереснее здесь словообразовательная модель. Фамилия образована не напрямую от имени, а через уменьшительную форму Стефанчик — так в быту могли звать ребёнка, младшего в семье или просто любимого сына. Суффикс -чик придаёт ласкательный оттенок, а последующее притяжательное окончание -ов/-ова закрепило за потомками значение «чей-то»: Стефанчикова буквально означает «дочь или жена Стефанчика», а в более широком смысле — «из рода Стефанчиковых».

Сама форма Стефанчик с сохранением «ф» вместо более привычного народного «Степан» выдает книжное, церковное происхождение. В крестьянской среде чаще звучало Степан, а вот Стефан — в среде грамотной, близкой к церкви или приказной службе. Поэтому можно предположить, что первые носители фамилии имели отношение к духовенству, дьячкам или посадским людям, умевшим читать и писавшим имя в его полной форме.

Сравните с однокоренными фамилиями: Степанов, Степанчиков, Стефановский. Степанов — самая частая, от народной формы имени. Стефановский — более поздняя, «дворянская» по звучанию, нередко от названия села. А вот Стефанчиков/Стефанчикова — редкий вариант, сохранивший именно уменьшительное прозвище. Такая фамилия могла возникнуть в XVI–XVII веках, когда после отмены местничества и при росте приказного делопроизводства прозвища начали закрепляться за родами.

В документах фамилия встречается редко, что говорит о её локальном бытовании, вероятно, в среднерусских или поволжских землях, где была сильна церковная традиция. Сегодня носители фамилии живут в разных регионах России, но генетически и исторически их корни, скорее всего, тянутся к семьям причетников или мелких служилых людей, которые ценили книжное имя Стефан.