Фамилия Суддин — редкий пример, где форма на -ин образована не от отчества, а напрямую от прозвища или, что вероятнее, от варианта личного имени. Основа здесь — Судда. В русской ономастике это усечённая или разговорная форма крестильного имени Суд, которое встречается в святцах крайне редко (имя древнееврейского происхождения, в переводе — «тайна»). Однако гораздо чаще Суддой в народе называли человека, получившего имя в честь библейского Судды, сына Завулона. В быту полное имя сократили, добавив характерный для северных и центральных говоров суффикс субъективной оценки -д- (ср. Ваня — Вандя, Федя — Феддя), и получилось Судда.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Суддин, то есть сын или потомок Судды. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ на -а/-я. Географически фамилия тяготеет к северо-западным областям России: Новгородская, Псковская, Тверская губернии. Именно там чаще встречались усечённые и уменьшительные формы канонических имён, которые потом закреплялись как фамилии.

Есть и вторая, менее вероятная версия: от прозвища Судда, связанного с диалектным словом «судда» — так в некоторых говорах называли судью или спорщика. Но в этом случае фамилия звучала бы как Суддин или Судьин, а форма с двойным -дд- как раз указывает на имя, а не на нарицательное слово. Поэтому версия с личным именем Судда выглядит убедительнее.

Встречаются варианты написания с одной буквой «д» — Судин, но это уже другая фамилия, образованная от имени Суда (сокращение от Судьи, Судислава). Суддин же — фамилия редкая, и её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких близких родов, где имя Судда передавалось по традиции. В дореволюционных источниках она фиксируется в основном среди крестьян и мещан, что типично для фамилий, образованных от нецерковных форм имён.