Фамилия Сурдейкин — редкий пример, где прозвищная основа не бросается в глаза, но при этом словообразовательная модель прозрачна. Суффикс -ин указывает на происхождение от прозвища или имени, оканчивающегося на -а/-я: Сурдейка. Именно от этой формы и пошла фамилия. Вопрос в том, что скрывается за корнем «сурдей-».

Самая вероятная версия — связь с диалектным словом «сурда» или «сурдей». В говорах северных и центральных губерний «сурдой» называли глухого человека (от латинского surdus — глухой, но слово могло прийти через церковнославянский или через народную латынь). Прозвище Сурдейка мог получить тот, кто плохо слышал или притворялся глухим. В ономастике известны фамилии Сурдин, Сурдов, Сурдуков — все они восходят к той же основе. Сурдейкин стоит в том же ряду, но с уменьшительным суффиксом -к-, который в прозвищах нередко имел не столько ласкательное, сколько бытовое значение: Сурдейка — «тот самый глуховатый».

Менее убедительная версия — от тюркского имени Сурдей (например, от «сур» — серый, или «су» — вода, с добавлением аффикса принадлежности). Но для центральной России, где фамилия встречается спорадически, это маловероятно. География бытования Сурдейкиных — в основном Пензенская, Тамбовская, Нижегородская области. Там в XIX веке фиксировались крестьяне и мещане с этой фамилией, что подтверждает её исконно русское, прозвищное происхождение.

В написании фамилии возможна путаница с Сурдикиным или Сурдейкиным — через «и» вместо «е». Но исторические документы, например ревизские сказки середины XIX века, устойчиво фиксируют вариант через «е». Это говорит о том, что произношение было с чётким «е», а не с редуцированным «и», что косвенно подтверждает связь с «сурдой» (глухим), а не с уменьшительным именем Сурка.