Фамилия Суркин образована от мирского имени или прозвища Сурка. В основе лежит название степного зверька — сурка, которого во многих краях именовали по-тюркски «сур». Однако прозвище могло носить и переносный смысл: Суркой нередко дразнили неповоротливого, малоподвижного человека, лентяя и соню, проводящего много времени в норе, как зверек.

Словообразовательная модель проста и прозрачна: к основе Сурк- добавлен притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Такой формант типичен для русских фамилий, образованных от слов, оканчивающихся на -а или -я. Первоначально Суркин означало «сын Сурки», то есть потомок человека с таким прозвищем.

Самые ранние письменные свидетельства о прозвище относятся к XVI веку. В труде историка С. Б. Веселовского записан Сурка Евстафьевич Панов, 1568 год, Ярославль. Это подтверждает, что имя бытовало в центральных русских землях задолго до того, как закрепилось в качестве фамилии.

Интересно, что фамилия Суркин имеет параллели среди однокоренных: Сурков, образованный от той же основы, но с суффиксом -ов, встречается заметно чаще. Разница объясняется тем, что -ов присоединялся к основам на согласный, а -ин — к основам на -а, хотя в народной речи формы могли смешиваться. Суркин — более редкий вариант, что делает его ценным для генеалогического поиска: носители такой фамилии, вероятно, происходят из одной или нескольких локальных ветвей.

Не стоит исключать и версию о связи с гидронимом или топонимом: в некоторых регионах речки и овраги называли Сурка по обилию зверьков в округе. Тогда прозвище могло закрепиться за человеком, жившим у такого места. Но эта гипотеза менее убедительна, поскольку прозвищные имена от названий животных в русской традиции встречались значительно чаще, чем отыменные географические обозначения.