Фамилия Тимакина — женская форма фамилии Тимакин, и её происхождение стоит искать в мужском имени или прозвище. В основе лежит уменьшительная форма одного из крестильных имён: Тимофей (греч. «почитающий Бога») или Тимон (греч. «чтимый»). В русской народной традиции эти имена сокращали до Тима, Тимоха, Тимоша, а от «Тима» через суффикс -ака образовали прозвище Тимака. Суффикс -ака в древнерусском языке часто придавал именам оттенок простонародности, ласкательности или, наоборот, некоторой грубоватости — так могли называть парня или мужика в деревне.

Фамилия образована по типичной для русского севера и центра модели: основа Тимак- плюс притяжательный суффикс -ин, который указывает на принадлежность «чей?» — сын Тимаки, то есть потомок человека по прозвищу Тимака. Мужская форма Тимакин фиксируется в переписных книгах XVII века, например, в Вологодском и Архангельском уездах, что подтверждает её северное происхождение. Ударение в фамилии обычно падает на второй слог: Тима́кина, хотя в некоторых говорах возможно смещение на первый.

Интересная деталь: фамилия Тимакина — редкий случай, когда основа не усекается. В отличие от более частых Тимофеев или Тимохин, здесь сохранился полный суффикс -ак-, что делает фамилию более архаичной по звучанию. По сословной принадлежности предки Тимакиных были, скорее всего, крестьянами или посадскими людьми, поскольку дворянские роды с такой фамилией в исторических документах не встречаются.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Тимаков, Тимашев, Тимонин, — Тимакин стоит особняком: суффикс -ин вместо -ов указывает на то, что прозвище отца заканчивалось на гласный, а не на согласный. Это мелкий, но характерный признак, по которому специалисты могут определить регион происхождения: -ин чаще встречается на севере и в Поволжье. Так что носительница фамилии Тимакина с высокой вероятностью может считать своими предками жителей северных русских земель.