Фамилия Тимонькин напрямую связана с именем Тимонька — так в старину в быту называли человека, носившего церковное имя Тимон. Само имя пришло из древнегреческого языка и переводится как «почитающий». То есть предок, давший начало фамилии, носил имя, которое подчёркивало уважение — к старшим, к традициям или к вере.

Однако здесь есть и второй, не менее правдоподобный поворот. Тимонька вполне могла быть уменьшительной формой гораздо более распространённого имени Тимофей, которое в переводе с греческого означает «почитающий Бога». Обе версии имеют право на жизнь, но вторая выглядит даже предпочтительнее: имя Тимофей было на Руси куда популярнее редкого Тимона, а значит, и производных от него форм в народе бытовало больше. В пользу этого говорит и то, что фамилии, образованные от полной формы имени (Тимонов, Тимофеев), обычно закреплялись за социальной верхушкой — знатью или семьями, пользовавшимися в своей местности большим авторитетом. Соседи уважительно звали таких людей полным именем, тогда как простых крестьян и ремесленников кликали уменьшительными, обиходными вариантами. Поэтому появление фамилии Тимонькин, скорее всего, указывает на то, что её первый носитель был человеком простого звания, но при этом уважаемым в своей общине — иначе его бы не выделили отдельным прозвищем.

Сама модель образования фамилии — через суффикс -ин — типична для центральной России и Поволжья. Она отвечает на вопрос «чей ты?»: Тимонькин значит «сын Тимоньки». Это один из самых древних типов русских фамилий, который складывался ещё в XV–XVII веках, когда отчество постепенно превращалось в наследственное родовое имя. Так что за фамилией Тимонькин стоит не просто имя, а целый пласт народной культуры: уменьшительная форма, которая звучала в каждом дворе, но в официальные документы попала лишь однажды — и осталась с семьёй навсегда.