Фамилия Толкунова образована от прозвища Толкун. В его основе — глагол «толочь», то есть «мельчить, дробить, разбивать; измельчать бойком, кием, толкачем, пестом; дробить в ступе». Перед нами типичное «профессиональное» именование: так на Руси могли прозвать человека, чья работа была связана с обработкой и измельчением зерна. Скорее всего, родоначальник Толкуновых был мельником, крупорушником или работником на ступе, где вручную дробили крупу.

Впрочем, у прозвища есть и второе, переносное значение. Толкуном в народе называли непоседливого, суетливого человека, который постоянно находится в движении, «толчётся» на одном месте. Эта версия не менее правдоподобна: такие прозвища по характеру давали не реже, чем по ремеслу. Сказать наверняка, какой смысл вкладывали в слово соседи предка Толкуновых, сегодня уже невозможно, но обе трактовки имеют право на существование.

Сама фамилия построена по простой и очень распространённой модели: к основе Толкун добавили суффикс -ов-, а форма Толкунова указывает на женскую линию или принадлежность семье. Первоначально Толкуновыми называли детей, внуков или домочадцев человека по прозвищу Толкун, и лишь со временем это именование закрепилось как наследственная фамилия.

Интересно, что фамилия Толкунова не единственная в этом ряду. От того же корня образованы Толкачёв, Толчеев, Толкушин — все они так или иначе связаны с глаголом «толочь» и его производными. Это говорит о том, что прозвища от «толчения» были в ходу в разных регионах и в разных социальных слоях, хотя чаще всего встречались в крестьянской и посадской среде, где переработка зерна была повседневным делом.