Фамилия Труничев образована по типичной русской модели с помощью патронимического суффикса -ев, который присоединяли к основе, оканчивающейся на мягкий согласный. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Труня. Это краткая форма от таких имён, как Трофим (в народном произношении — Труфим, Труня) или Терентий (просторечное Труня). Вторая версия, менее распространённая, выводит Труню из диалектного слова «трун» — так в некоторых областях называли человека медлительного, вялого или неряшливого. Оба варианта правдоподобны, но связь с крестильным именем Трофим выглядит более естественной: в русской ономастике переход «Трофим → Троня → Труня» встречается нередко, а суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?» — сын Труни).

С точки зрения географии фамилия Труничев тяготеет к центральным и северным регионам России. Наибольшая концентрация носителей фиксируется в Костромской, Вологодской и Кировской областях, что косвенно подтверждает связь с северорусским произношением имени Трофим. В южных говорах форма «Труня» почти не встречалась, поэтому фамилия остаётся локальной, не распространившись широко по всей стране.

Социальный контекст фамилии типичен для крестьянской среды. Вплоть до XIX века крестьяне редко пользовались полными церковными именами, заменяя их на бытовые сокращения. Труничев — не дворянская и не купеческая фамилия, а родовое имя, закрепившееся за потомками человека, которого в обиходе звали Труней. Однофамильцы с такой же основой — Трунин, Трунев, Трунёв — образуют компактную группу, где Труничев выделяется редким сочетанием суффикса -ич- и -ев, что говорит о возможном влиянии местного говора на словообразование.