Фамилия Тюньков — один из тех случаев, когда внешне простая основа скрывает неочевидную этимологию. Если с суффиксом всё ясно: -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Тюнька), то происхождение самого прозвища Тюнька требует разбора.

Самая вероятная версия связывает основу с диалектным словом «тюня» или «тюнька». В русских говорах так называли вялого, медлительного или плаксивого человека — примерно как «тюха» или «тюфяк». В словаре Даля «тюня» — это «плакса, разиня». Если предок получил такое прозвище за характер или манеру поведения, то фамилия Тюньков буквально означает «потомок Тюньки». Модель образования типична для крестьянских и мещанских фамилий Центральной России и Поволжья: прозвище на -ка (Тюнька) плюс патронимический суффикс -ов.

Есть и менее очевидная версия, которую стоит упомянуть из-за её географической привязки. В некоторых областях (например, в рязанских и тамбовских говорах) «тюнькать» означало «стучать, тихо постукивать» или «звенеть». Тогда Тюнькой могли прозвать мастера по металлу — кузнеца или жестянщика, чья работа сопровождалась характерным звуком. Эта гипотеза слабее первой, так как глагол узко локален, а прозвищ по характеру в русской ономастике гораздо больше, чем по звукоподражанию ремеслу.

Интересно, что фамилия Тюньков встречается заметно реже, чем её однокоренные «собратья» — Тюнин, Тютин или Тюхин. Это говорит о том, что исходное прозвище Тюнька было не слишком распространено и закрепилось, скорее всего, в одной-двух местностях. В переписных книгах XVII века такие фамилии почти не фиксируются — они относятся к более позднему слою, когда прозвища на -ка активно переходили в фамилии у непривилегированных сословий.