Фамилия Уханкова — женская форма фамилии Уханков, и её разумнее разбирать через мужской вариант. Основа здесь — прозвище Уханко, которое образовано от слова «ухо» с помощью уменьшительно-пренебрежительного суффикса -анк- (ср. «уханька» — ухо, ушко). В говорах «ухан» или «ухань» могло означать человека с большими, оттопыренными или просто заметными ушами. Прозвища по частям тела — один из древнейших пластов русской антропонимии: так могли назвать за характерную внешность, и это необязательно считалось обидным, скорее — отличительным.

Суффикс -ов в фамилии Уханков — стандартный русский патронимический формант, указывающий на принадлежность: «чей?» — «Уханков», то есть сын Уханка. Модель типична для фамилий, сложившихся в XV–XVII веках в среде крестьян, посадских людей и служилых. В отличие от фамилий на -ин, которые чаще образовывались от основ на -а/-я, здесь -ов присоединился к основе на -о, что грамматически правильно для мужских прозвищ.

В ономастических источниках фамилия Уханков нередко упоминается в контексте рязанских и тульских говоров, где слово «ухан» бытовало в значении «ухо» или «ушастый». Встречаются и более редкие версии: от глагола «ухать» — кричать, аукать. В этом случае прозвище Уханко мог получить человек с громким голосом или тот, кто работал в поле и перекликался. Но версия с ушами выглядит правдоподобнее: глагольные прозвища чаще образовывались через суффикс -ун (крикун, ворчун), а -анк- типичен именно для анатомических названий (лопух — лопан, брюхо — брюхан).

Фамилия Уханкова, как и Уханков, встречается преимущественно в центральной России, особенно в Тульской, Рязанской и Липецкой областях. Сословно это, скорее всего, крестьянская или мещанская фамилия: в дворянских родословных книгах она не фиксируется. Ударение традиционно падает на второй слог: Уха́нков, Уха́нкова.