Фамилия Устенко относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от крестильного имени Устин. Фамилия Устенко образована от имени Устя - просторечной формы имени Устин, Юстин (от латинского имени Юстинус, образованного от Юстус - "справедливый, праведный"). Покровителем имени Устин является Святой мученик Иустин-философ, самый значительный апологет Христианства II века. Он создал целую школу христианской философии и апологетики в Риме, которая, впрочем, не пережила своего основателя и его немногочисленных учеников. Все шестеро его ближайших сотрудников и студентов были казнены вместе с их святым наставником. Менее вероятной кажется версия о связи фамилии с существительным "устье" и названием деревень с названием Устье. Деревня Устье впервые упоминается в писцовой книге 1558 г. в качестве собственности Савво-Сторожевского монастыря (нынешняя московская область). Еще одна деревня с аналогичным названием находилась на Нижней Печоре (рыбацкое поселение, образованное в XV-XVI веках). Поэтому Устенко буквально понималось как «сын Усти».