Фамилия Ваканин — одна из тех, что проще всего понять, если посмотреть на её финальную часть. Суффикс -ин указывает на притяжательную модель: такую фамилию давали по отцу, а в основе лежит личное имя или прозвище, которое заканчивалось на -а или -я. В данном случае это Вакана. Но что это за имя или прозвище?

Самая прямая версия — прозвище Вакана от глагола вакать, то есть «мяукать», «издавать слабый, жалобный звук». В диалектах (особенно северных и сибирских) так могли сказать о плаксивом ребёнке, о человеке с тонким голосом или о том, кто постоянно ноет. Соответственно, Ваканин — это «сын Ваканы», то есть потомок человека, получившего такое прозвище.

Второй, менее очевидный вариант — связь с диалектным словом вакать в значении «говорить впустую, болтать вздор», а также с существительным вака — «пустомеля». В этом случае прозвище носило бы ироничный оттенок и давалось болтуну.

В ономастических справочниках фамилия Ваканин встречается редко, что говорит о её локальном происхождении. Скорее всего, она возникла в среде крестьян или посадских людей на Русском Севере или в Поволжье — именно там фиксируются говоры со словом «вакать». Сравните с однокоренными фамилиями Ваканов (от той же основы, но с суффиксом -ов, что тоже возможно, если прозвище звучало как Вакан) или Вакин (от имени Вака, краткой формы от Иван или Вакула). Однако Ваканин стоит особняком: суффикс -ин жёстко привязывает фамилию к конкретному прозвищу на -а, а значит, предок носителя был известен именно как Вакана.

Если рассматривать гипотезу о тюркских корнях (например, от слова «вак» — «время» в некоторых языках), то она слаба: для русской фамилии нехарактерен такой перенос без дополнительных суффиксов, и география распространения Ваканиных этого не подтверждает.

Таким образом, Ваканин — фамилия прозвищного происхождения, образованная от просторечного слова, описывающего манеру речи или голос. Её носитель в XVI–XVII веках, скорее всего, жил в северорусской или волжской деревне и получил прозвище за свою говорливость или плаксивость, которое затем закрепилось за его потомками.