Основой фамилии Вахатов послужило церковное имя Вахтисий. Фамилия Вахатов ведет свое начало от имени Вахат, разговорной формы крестильного мужского имени Вахтисий. Это имя имеет персидское происхождение и переводится на русский язык как «счастливый». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Вахат, со временем получил фамилию Вахатов.