Фамилия Ванина восходит к каноническому мужскому личному имени Иоанн (в переводе с древнееврейского –«милость Божья»). В основе фамилии лежит просторечная форма этого имени – Ваня. Скорее всего, основатель рода Ваниных был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ваня, со временем получил фамилию Ванина.