Фамилия Ванина — одна из тех, что образованы напрямую от имени, точнее — от его обиходной, домашней формы. В основе лежит имя Ваня, которое является просторечным вариантом церковного имени Иоанн. В переводе с древнееврейского Иоанн означает «милость Божья», но до крестьянской и рабочей среды XVIII–XIX веков это книжное значение почти не доходило: фамилию давали по тому имени, которое человек носил в быту.

Модель образования здесь типичная для русского севера и центральных губерний: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Ванин, то есть сын или потомок Вани). Такая схема характерна для фамилий, возникших в простонародной среде — у крестьян, мещан, ремесленников. Дворянские роды чаще оформляли фамилии через -ов/-ев, поэтому Ванины — это почти наверняка потомки людей из податных сословий.

Любопытно, что фамилия Ванина — женская форма, но её носительницами могут быть как женщины, так и — в редких случаях — мужчины, если фамилия не склоняется по правилам русского языка (что нетипично). Чаще всего в документах встречается мужской вариант — Ванин, а Ванина — это форма, закреплённая за женщиной (например, «Мария Ванина»).

С однокоренными фамилиями — Ванин, Ваничкин, Ваньков — Ванину роднит общий корень, но суффикс -ин делает её одной из самых прямых и прозрачных по смыслу: «дочь (или жена) Вани». Географически фамилия распространена по всей России, но чуть чаще встречается в Поволжье и на Урале, где в XIX веке была высока доля крестьянского населения, получавшего фамилии по отчеству без изменений.

Таким образом, фамилия Ванина не скрывает тайны: она прямо говорит о предке, которого в быту звали Ваней. Никакого прозвища, ремесла или географического названия за ней нет — только имя, ставшее родовым.