Фамилия Варакиан — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не связано с исконно славянскими корнями. В первую очередь обращает на себя внимание окончание -ан, которое совершенно нехарактерно для русских фамилий, образованных от прозвищ или профессий. Такое окончание — верный признак того, что перед нами фамилия закавказского происхождения, скорее всего армянского.

В армянском языке суффикс -ян (-յան) означает принадлежность к роду, и фамилии на -ян составляют подавляющее большинство. Основа «Варак» (Varak) указывает на конкретную местность или имя. Самая вероятная версия: фамилия образована от названия горы Варак (Varak) — одной из священных гор в исторической области Васпуракан, на востоке современной Турции. У подножия этой горы находился знаменитый монастырь Варакаванк. Предки носителя фамилии, таким образом, могли происходить из этого региона или быть выходцами из села, названного в честь горы.

Менее распространённая, но возможная версия связывает фамилию с личным именем Варак, которое в древнеармянском языке могло означать «подарок» или «дар». В этом случае Варакиан — «из рода Варака», то есть потомок человека с таким именем. В русском языке фамилия закрепилась в форме «Варакиан» — с ударением, скорее всего, на последний слог, как это свойственно армянским фамилиям, но в бытовой речи могло сместиться и на второй.

Встретить эту фамилию можно в основном на юге России, в Краснодарском крае, Ставрополье, Ростовской области, а также в Москве и Санкт-Петербурге — там, куда мигрировали армянские общины в XIX–XX веках. Среди носителей нет широко известных исторических деятелей, что говорит о том, что фамилия оставалась локальной и не попала в дворянские родословные книги Российской империи. Социально это, скорее всего, фамилия крестьян или ремесленников, переселившихся в русские губернии в поисках работы.

Таким образом, Варакиан — это не русская фамилия в привычном понимании, а армянская, адаптированная русским письмом. Её значение — «из рода (или с горы) Варак», и она напрямую отсылает к географическому или личному имени, уходящему корнями в историю средневековой Армении.