Фамилия Варков образована именования Варко, которое является западнославянской уменьшительной формой имен Варварий (от греческого «чужеземный») или Варахисий (Варак, Вараксий) в переводе с еврейского означающего «возможно, благословенный Иисусом». Нельзя исключить, что именование Варко является мирским именем, которое восходит к аналогичному украинскому слову со значением «душно, жарко». Именем Варко родители обычно нарекали ребенка, родившегося в жаркую, знойную погоду. Менее вероятно, что прозвище Варко образовано от глагола «варить», что в переводе на русский язык означает «варить, приготовлять пищу». Вероятно, основатель рода Варков был хорошим поваром. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Вапрко, со временем получил фамилию Варков.