Фамилия Василисов — редкий случай, когда за привычным окончанием скрывается нестандартная основа. На первый взгляд кажется, что перед нами типичная «овская» фамилия, образованная от имени Василий. Но если приглядеться, суффикс здесь не -ов, а -исов, и это меняет всю картину.

В русской ономастике фамилии на -исов встречаются нечасто. Чаще всего они указывают на греческое или церковное происхождение. Основа «Василис» — это не просто усечённая форма имени Василий, а прямая отсылка к греческому женскому имени Василиса (βασίλισσα — «царица»). В русской традиции так называли девочек в крестьянских и купеческих семьях, и имя это было вполне употребительным. Таким образом, Василисов — это отчество от женского имени Василиса, то есть «сын Василисы». Подобная модель (от имени матери) встречается реже, чем отчества от отца, но она существовала, особенно если мать была главой семьи, вдовой или просто уважаемой женщиной в общине.

Другая, менее вероятная версия — связь с фамилией Василисков, где выпал звук «к». Василиск — мифическое существо, но в качестве прозвища оно могло закрепиться за человеком с острым взглядом или тяжёлым характером. Однако в этом случае мы бы ожидали форму Василисков, а не Василисов, поэтому версия с именем Василиса выглядит убедительнее.

Географически фамилия Василисов тяготеет к южнорусским и украинским регионам, где греческое влияние через церковные календари было сильнее. Встречается она и в среде старообрядцев, которые часто сохраняли архаичные формы имён. В любом случае, носитель фамилии может с уверенностью сказать, что его предок носил имя или прозвище, связанное с «царственным» корнем — будь то женщина по имени Василиса или человек с прозвищем Василис.